Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ttc29Q80VM3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ttc29Q80VM3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ttc29Q80VM3 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ttc29Q80VM3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ttc29Q80VM3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ttc29Q80VM3 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ttc29Q80VM3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ttc29Q80VM3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ttc29Q80VM3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ttc29Q80VM3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ttc29Q80VM3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ttc29Q80VM3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc29Q80VM3 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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