Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrc2bQ7TPM1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms