Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Nudcd1Q6PIP5 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms