Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

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Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Dtx4Q6PDK8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Dtx4Q6PDK8 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Dtx4Q6PDK8 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Dtx4Q6PDK8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Dtx4Q6PDK8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Dtx4Q6PDK8 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Dtx4Q6PDK8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Dtx4Q6PDK8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Dtx4Q6PDK8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Dtx4Q6PDK8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Dtx4Q6PDK8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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