Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Msl2Q69ZF8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Msl2Q69ZF8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Msl2Q69ZF8 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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