Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Pkp4Q68FH0 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Pkp4Q68FH0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Pkp4Q68FH0 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Pkp4Q68FH0 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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