Protein–RNA interactions for Protein: Q64446

Atp7b, Copper-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp7bQ64446 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Atp7bQ64446 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Atp7bQ64446 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp7bQ64446 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp7bQ64446 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp7bQ64446 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp7bQ64446 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Atp7bQ64446 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp7bQ64446 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Atp7bQ64446 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Atp7bQ64446 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp7bQ64446 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Atp7bQ64446 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Atp7bQ64446 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp7bQ64446 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp7bQ64446 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp7bQ64446 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp7bQ64446 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp7bQ64446 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp7bQ64446 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp7bQ64446 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp7bQ64446 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp7bQ64446 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp7bQ64446 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp7bQ64446 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp7bQ64446 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp7bQ64446 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp7bQ64446 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms