Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
AtmQ62388 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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AtmQ62388 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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AtmQ62388 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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AtmQ62388 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
AtmQ62388 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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