Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Taf6Q62311 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms