Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pabpc2Q62029 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pabpc2Q62029 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pabpc2Q62029 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pabpc2Q62029 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pabpc2Q62029 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pabpc2Q62029 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pabpc2Q62029 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms