Protein–RNA interactions for Protein: Q62012

Gm15085, Ott protein, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm15085Q62012 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm15085Q62012 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms