Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cd47Q61735 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cd47Q61735 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cd47Q61735 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd47Q61735 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms