Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 AC122357.1-202ENSMUST00000221436 633 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
AtrxQ61687 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
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