Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atf3Q60765 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atf3Q60765 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms