Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Xrcc1Q60596 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Xrcc1Q60596 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Xrcc1Q60596 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Xrcc1Q60596 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Xrcc1Q60596 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Xrcc1Q60596 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Xrcc1Q60596 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Xrcc1Q60596 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Xrcc1Q60596 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Xrcc1Q60596 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xrcc1Q60596 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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