Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Sft2d1Q5SSN7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms