Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Trim58Q5NCC9 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Trim58Q5NCC9 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Trim58Q5NCC9 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Trim58Q5NCC9 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Trim58Q5NCC9 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Trim58Q5NCC9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Trim58Q5NCC9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Trim58Q5NCC9 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Trim58Q5NCC9 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim58Q5NCC9 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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