Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Fam208bQ5DTT3 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms