Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trp53i11Q4QQM4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trp53i11Q4QQM4 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms