Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lin28bQ45KJ6 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms