Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rbm44Q3V089 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rbm44Q3V089 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rbm44Q3V089 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rbm44Q3V089 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rbm44Q3V089 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rbm44Q3V089 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Rbm44Q3V089 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Rbm44Q3V089 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Rbm44Q3V089 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Rbm44Q3V089 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rbm44Q3V089 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms