Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms