Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Shisa3Q3UPR0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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