Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Skap2Q3UND0 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms