Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Tmem253Q3UNB8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem253Q3UNB8 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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