Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Aamdc-214ENSMUST00000178078 723 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Aamdc-201ENSMUST00000042627 627 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm6482-201ENSMUST00000168128 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Olfr380-203ENSMUST00000127789 1536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 AC133598.5-201ENSMUST00000224937 1517 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Med6-205ENSMUST00000161598 897 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 5730420D15Rik-201ENSMUST00000181781 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf166Q3U9F6 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms