Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otud5Q3U2S4 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms