Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
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Kdm4dQ3U2K5 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms