Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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Rnf149Q3U2C5 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Rnf149Q3U2C5 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Rnf149Q3U2C5 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Rnf149Q3U2C5 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Rnf149Q3U2C5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Rnf149Q3U2C5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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