Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LcorlQ3U285 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms