Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms