Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms