Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ctdnep1Q3TP92 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ctdnep1Q3TP92 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctdnep1Q3TP92 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ctdnep1Q3TP92 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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