Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms