Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Cntn3Q07409 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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Cntn3Q07409 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cntn3Q07409 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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Cntn3Q07409 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cntn3Q07409 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Cntn3Q07409 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cntn3Q07409 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cntn3Q07409 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Cntn3Q07409 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cntn3Q07409 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cntn3Q07409 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Cntn3Q07409 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Cntn3Q07409 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cntn3Q07409 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cntn3Q07409 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cntn3Q07409 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cntn3Q07409 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Cntn3Q07409 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cntn3Q07409 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Cntn3Q07409 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cntn3Q07409 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Cntn3Q07409 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Cntn3Q07409 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cntn3Q07409 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cntn3Q07409 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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Cntn3Q07409 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Cntn3Q07409 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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Cntn3Q07409 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cntn3Q07409 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cntn3Q07409 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cntn3Q07409 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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