Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sh3bp2Q06649 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms