Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms