Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grin2bQ01097 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms