Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Rbp4Q00724 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms