Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shc1P98083 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shc1P98083 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shc1P98083 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Shc1P98083 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms