Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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SmsP97355 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SmsP97355 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SmsP97355 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SmsP97355 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SmsP97355 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SmsP97355 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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SmsP97355 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SmsP97355 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SmsP97355 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SmsP97355 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SmsP97355 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SmsP97355 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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SmsP97355 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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SmsP97355 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SmsP97355 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SmsP97355 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SmsP97355 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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SmsP97355 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SmsP97355 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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SmsP97355 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SmsP97355 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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SmsP97355 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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SmsP97355 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmsP97355 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmsP97355 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SmsP97355 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms