Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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