Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SgcdP82347 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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