Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Irx3P81067 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Irx3P81067 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Irx3P81067 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms