Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nphp4P59240 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms