Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms