Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ube2e3P52483 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms