Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ClgnP52194 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ClgnP52194 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ClgnP52194 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms