Protein–RNA interactions for Protein: P50592

Tnfsf10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf10P50592 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsf10P50592 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsf10P50592 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms