Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms